En 2006, plus de 85% des animaux engraissés en bio étaient valorisés dans les filières biologiques. Le manque de structuration des filières bio est souvent montré du doigt. La filière viande bovine est une filière qui se structure d’année en année. Des partenariats se sont développés avec les acteurs de la filière (groupements d’éleveurs, abattoirs, transformateurs, distributeurs…) et essentiellement basés sur une régulation entre l’offre et la demande.

La région des Pays de la Loire, avec ses 289 éleveurs, se place au premier rang au niveau national concernant son cheptel de vaches allaitantes (17% du cheptel bio national).

Au niveau de la filière longue, la filière se structure autour d’E.BIO, unique groupement d’éleveurs spécialisé bio( lire ci-dessous). La région des Pays de la Loire possède également des outils de transformation (Bio Loire Poitou, TVR, Charal…) et des abattoirs performants (Le Lion d’Angers, Les Herbiers, La Fosse de Tigné…).

Le réseau CAB tient une place importante dans le développement de cette filière, qui recherche de nouveaux éleveurs tant sur la filière longue que sur la vente directe.

Depuis 1996, E.BIO cherche à dynamiser l'activité des filières longues et affiche sa volonté d'impliquer davantage ses adhérents, notamment par une recherche constante de nouveaux débouchés. L'association E.BIO à plusieurs missions : la promotion de la viande biologique (filière bovine et ovine), mais également  la défense des intérêts de ses adhérents. Elle travaille aussi sur des aspects techniques comme la planification de la production de viande bio, le développement d'une dynamique d'engraissement, elle apporte des appuis technico - économiques aux éleveurs, et tout ceci, en relation étroite avec la SAS UNEBIO. Depuis 2004, la structure commerciale UNEBIO réalise un travail efficace en approvisionnant aussi bien les GMS, magasins spécialisés Bio (réseau Biocoop), les boucheries traditionnelles et un travail récent sur la RHD ;  elle est devenue la 1^ère entreprise française de commercialisation de viande biologique.

Afin de répondre aux réalités commerciales des filières de valorisation des bovins et veaux biologiques, des règles de fonctionnement existent entre la SAS UNEBIO et l'association ; une convention lie en effet les éleveurs et elle met en avant l'importance d'établir des mises en contrats et prévisions de sorties des animaux à E.BIO. Chaque éleveur s'engage ainsi à valoriser ses animaux pour répondre au mieux aux besoins de la filière.

Les éleveurs biologiques des Pays de la Loire se sont engagés dans un mode de production respectueux de l'environnement et du travail de l'homme, avec le souci de fournir aux consommateurs des produits de qualité. Fort de ses 300 adhérents en bovins viande et lait, E.BIO veut développer une filière structurée et motiver la grande majorité des éleveurs pour pérenniser la production.

Pour la production ovine, E.BIO souhaite renforcer sa dynamique. Une nouvelle convention existe et garantit une priorité dans les sorties des agneaux pour les éleveurs qui communiquent à l'association leurs prévisions de sorties.

Depuis un an, E.BIO travaille également le développement des débouchés régionaux avec la mise en œuvre d'une démarche collective menée avec des éleveurs en vente directe. E.BIO répond à des demandes de magasins spécialisés, restaurants d'entreprise...Les objectifs sont d'apporter une régularité des approvisionnements avec un service et une qualité des produits irréprochables. Pour réussir, il faut bien entendu un groupe d'éleveurs motivés autour de valeurs fortes et qui se veulent attractives pour le territoire tout en confortant leur activité à la ferme. Depuis plusieurs mois, E.BIO affiche le souhait de développer cette filière de proximité et ce, grâce au travail mené par les acteurs de ce projet : les ateliers, les éleveurs et la confiance portée par les gérants de magasins spécialisés.

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